首先，政治經(jīng)濟學(xué)研究經(jīng)濟制度的歷史運動規(guī)律，特別是馬克思的政治經(jīng)濟學(xué)是以（資本主義）生產(chǎn)關(guān)系的產(chǎn)生、發(fā)展和滅亡的規(guī)律為對象，只要存在社會生產(chǎn)關(guān)系及其歷史運動，就需要開展政治經(jīng)濟學(xué)的研究。中國特色社會主義以發(fā)展為第一要務(wù)，而社會的發(fā)展歸根結(jié)底是社會生產(chǎn)力的發(fā)展，社會生產(chǎn)力的發(fā)展又是在一定社會生產(chǎn)關(guān)系中進行，因此，生產(chǎn)力與生產(chǎn)關(guān)系的矛盾運動，以及通過改革完善社會主義生產(chǎn)關(guān)系與社會生產(chǎn)力解放和發(fā)展之間的能動關(guān)系，便成為發(fā)展中國特色社會主義的主線，必須加以深入研究。
其次，政治經(jīng)濟學(xué)研究人與人的生產(chǎn)關(guān)系，根本目的是要論證特定的生產(chǎn)方式產(chǎn)生的歷史必然及其發(fā)展和滅亡的歷史趨勢，是要證明或否定一定社會生產(chǎn)方式的合理性（或不合理性）。社會主義制度正處在探索、創(chuàng)新、發(fā)展的歷史進程中，如何發(fā)展、創(chuàng)新、完善這一社會制度？這一制度在人類歷史上取代資本主義制度的歷史必然性究竟是否存在？中國特色社會主義制度前途何在？這些命題還在探索中，需要政治經(jīng)濟學(xué)者做出科學(xué)的回答。
第三，中國特色社會主義經(jīng)濟制度建設(shè)的核心在于，在公有制為主體（多種所有制經(jīng)濟長期共同發(fā)展）的基本制度基礎(chǔ)上，建立市場經(jīng)濟機制，使市場機制在資源配置中起決定性作用。如何統(tǒng)一公有制與市場機制？這是中國特色社會主義經(jīng)濟制度建設(shè)面臨的根本問題，也是對中國特色社會主義進行政治經(jīng)濟學(xué)研究需要回答的根本問題。
第四，政治經(jīng)濟學(xué)作為研究生產(chǎn)關(guān)系、回答社會制度的歷史正義性的社會科學(xué)，其所要解答的問題是別的學(xué)科所不能替代的。如，政治經(jīng)濟學(xué)是重科學(xué)主義，還是更重人文關(guān)懷？政治經(jīng)濟學(xué)是重價值取向上的階級屬性，還是更重其解析能力上的邏輯性？政治經(jīng)濟學(xué)的分析是重思想內(nèi)容的深邃性，還是更重表達(dá)形式的完美性？等等。