李克農(nóng)領導的中央調(diào)查部作為全國情報工作的具體組織者和實施者，通過艱苦細致的調(diào)查研究，在事關黨和國家安全利益等重大問題上，而且往往在關鍵時刻，為黨和國家提供決策情報，成為黨中央工作的重要參謀與助手。
李克農(nóng)(右4)在天安門城樓與戰(zhàn)友合影
李克農(nóng)任部長后，中調(diào)部在一些省和大城市建立了自己的常設或非常設機構。1955年8月，中共廣東省和中共云南省分別建立了調(diào)查部。中共上海市委調(diào)查部1955年6月成立，當時的編制是48名干部，由4個處室組成。只有河南省沒有成立過調(diào)查部。
1955年9月，李克農(nóng)被授予上將軍銜，獲一級八一勛章、一級獨立自由勛章和一級解放勛章。他是這次被授予上將軍銜的52名將軍中唯一一個沒有領過兵、打過仗的將軍，名副其實的情報上將。
在反和平演變上，李克農(nóng)領導的中央調(diào)查部起到了重要智囊作用。1956年蘇共二十大和“波匈事件”后，時任美國國務卿的艾倫·杜勒斯的哥哥約翰·杜勒斯宣稱資本主義世界要有這樣一個“基本的信念”：“如果它繼續(xù)要有孩子的話，而他們又有孩子的話，他們的后代將獲得自由。”這就是通常所說的西方帝國主義把“和平演變”的希望寄托在共產(chǎn)黨第三、四代人身上。李克農(nóng)將中調(diào)部收集的美國為首的西方國家企圖“和平演變”的重要情報直接呈送給中國共產(chǎn)黨、政府和軍隊的決策者，受到毛澤東的高度重視。毛澤東敏銳地抓住帝國主義對社會主義戰(zhàn)略策略重點改變這一重大問題，旗幟鮮明地提出防止“和平演變”，并將防止“和平演變”作為中國共產(chǎn)黨長期堅持的一個戰(zhàn)略方針。
我黨出色的隱蔽戰(zhàn)線領導人李克農(nóng)
1958年秋，美國國會舉行選舉，執(zhí)政的共和黨敗于民主黨。李克農(nóng)組織中調(diào)部寫了一個報告，分析了這次選舉后的美國國內(nèi)的政治局勢，指出在嚴重的經(jīng)濟危機情況下，美國統(tǒng)治集團內(nèi)部和國內(nèi)的階級矛盾加劇，各階層人民普遍恐懼戰(zhàn)爭，國內(nèi)政治氣氛在往好的方面發(fā)展。毛澤東在審閱此報告時，將題目改為《美國政治氣氛向好的方面發(fā)展》，并批示說:中央調(diào)查部這個分析，很有意思。還說:“總之，西方世界一天一天地在向好的方面變，無產(chǎn)階級的直接同盟軍和間接同盟軍都在發(fā)展。”中共八屆六中全會上印發(fā)了毛澤東的批語和中央調(diào)查部的分析報告。
坐落在北京西郊風景區(qū)的國際關系學院是以外語、國際問題為教學科研的全國重點大學，在世界上也很有名氣，它是在李克農(nóng)領導下創(chuàng)辦的。
國際關系學院受到黨和國家領導人的重視和關懷，周恩來總理曾親自批準建校，并到校視察;陳毅元帥親筆題寫院名。
李克農(nóng)領導創(chuàng)辦的國際關系學院
1955年初，中調(diào)部接手了一所學校，其前身是外交知識和外交事務培訓班，這個班是李克農(nóng)根據(jù)周恩來的要求，為中華人民共和國首批駐外大使和高級外交官開辦的。國際關系學院前身是1949年創(chuàng)建的中央外事干部培訓班，新中國第一批“將軍大使”正是從這里受訓后走向世界的。第一批學員大多任職于外交部，有些人后來擔任了中調(diào)部的領導。
20世紀50年代，在李克農(nóng)的力挺下，外交事務培訓班被擴大規(guī)模命名為“外事干部學校”。后來，中共中央宣布，未來幾年急需大量懂外語的干部，“以便利用世界先進科技加快我國社會主義建設”，需要提高情報人員的質(zhì)量和數(shù)量。因此，李克農(nóng)要求中調(diào)部再次擴大規(guī)模，“把現(xiàn)有的干部學校改為一所外語學院”，他的建議得到了黨中央批準。1961年“外事干部學校”擴大規(guī)模為“外交學院分院”。1965年，外交學院分院正式更名為“國際關系學院”。
青年時期的李克農(nóng)
“國際關系學院”先后開設了國際政治、國際關系、世界經(jīng)濟、國際公共采購學、政治經(jīng)濟學、西方經(jīng)濟學、英語語言文學、法語語言文學、日語語言文學、公共外交與文化傳播、國際關系與國際法、國際事務管理、中外政治制度等特有專業(yè)，為國家安全部門培養(yǎng)了大批優(yōu)秀人才，這與當年中調(diào)部長李克農(nóng)的精心栽培是分不開的。
李克農(nóng)晚年的時候，身體狀況極差。1961年，病中的李克農(nóng)做的最后一件事情就是搜集資料，總結早年我黨上海特科情報和鋤奸的經(jīng)驗，以鑒后人。李克農(nóng)訪問情報戰(zhàn)線烈士家屬，查閱歷史檔案，同時調(diào)查了解曾在隱蔽戰(zhàn)線上做出成就的老同志的生活和工作現(xiàn)狀，并給予妥善的處理、安排。他在生命的倒計時最后給黨中央說，我一定要把這個事情解決了。這些隱蔽戰(zhàn)線的同志，為國家付出了多少，忍辱負重，包括他們的孩子，他們的親屬，然后背負了多少屈辱。李克農(nóng)最后的情結就是一定要在他有生之年，把這些為國家做出貢獻的，忍辱負重的人，給一個合適的安置，他最后才能瞑目。
李克農(nóng)擔任中央調(diào)查部部長后，統(tǒng)領全國的情報工作，在隱秘戰(zhàn)線為新中國的建設和發(fā)展作出了歷史性貢獻，為黨和國家的情報工作積累了豐富歷史經(jīng)驗。李克農(nóng)主管全國情報工作后，毛澤東主席曾表揚說，李克農(nóng)干得不錯。周恩來總理也譽稱：李克農(nóng)為新中國立下的功勞絕對比一個軍的作用還要大!
李克農(nóng)塑像
1962年2月9日，李克農(nóng)因腦軟化在北京協(xié)和醫(yī)院逝世。劉少奇、周恩來、鄧小平、陳云等領導人到醫(yī)院向其遺體告別，首都各界2500多人在中山堂隆重舉行公祭，黨中央對李克農(nóng)在中調(diào)部的工作和一生的紅色情報生涯給予了高度評價。